按原料是否熟化處理可分為生麥曲和熟麥曲。
按曲中的添加物來分，又有很多種類，如加入中草藥的稱為藥曲，加入豆類原料的稱為豆曲(碗豆，綠豆等)。
按曲的形體可分為大曲(草包曲、磚曲、掛曲)和小曲(餅曲)、散曲。
按酒曲中微生物的來源，分為傳統酒曲(微生物的天然接種)和純種酒曲(如米曲霉接種的米曲，根霉菌接種的根霉曲，黑曲霉接種的酒曲)。
現代大致將酒曲分為五大類，分別用于不同的酒。它們是：
麥曲，主要用于黃酒的釀造;
小曲，主要用于黃酒和小曲白酒的釀造;
紅曲，主要用于紅曲酒的釀造(紅曲酒是黃酒的一個品種);
大曲，用于蒸餾酒的釀造;
麩曲，這是現代才發展起來的，用純種霉菌接種以麩皮為原料的培養物?？捎糜诖娌糠执笄蛐∏?。目前麩曲法白酒是我國白酒生產的主要操作法之一。其白酒產量占總產量的70%以上。
